人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)的流行是艾滋病的病原体，是世界上主要的公共卫生问题之一，目前约有3 700万人感染了这种病毒。HIV-1流行病起源于中非，起源于1920年左右从黑猩猩传染给人类的一种病毒，这种病毒通过突变和重组已经广泛分化成许多变体，命名为亚型和循环重组形式。

图1所示。在FSU国家主导HIV-1流行的亚型A变异的祖先从刚果民主共和国迁移到乌克兰敖德萨，随后扩散到其他FSU国家。

HIV-1的流行最早于1981年在美国被发现，其主要变种是B亚型，随后传播到西欧和其他地方。然而，在前苏联的东欧和中亚国家，主要的HIV-1基因形式是a亚型变体。这种变异于1994年底开始在乌克兰港口城市敖德萨的注射吸毒者(IDUs)中传播，随后传播到前苏联(FSU)的所有东欧和中亚国家，因此它通常被指定为A_前苏联．在FSU国家，感染艾滋病毒-1的人数约为150万，从2000年到2014年，新感染人数增加了30%，这是这一时期艾滋病毒-1流行的最大区域增长。A的起源_前苏联一直存在争议，提出了两种相互竞争的假设，一种认为它发生在中非的刚果民主共和国(DRC)，另一种认为发生在西非的几内亚共和国(RG)。这些假设基于系统发育分析，系统发育分析显示，在刚果民主共和国采集的两种病毒和在意大利采集的一种病毒(来自最近从刚果民主共和国移民的个体)的序列与甲型h1n1流感病毒密切相关_前苏联变体。在这项新的研究中，采用了一种基于贝叶斯概率的不同方法，即使用从不同非洲和FSU国家收集的已知采样年的a亚型病毒序列来估计a的时间和地理起源_前苏联变种及其最可能的迁移路线。在这些分析中，估计A_前苏联其祖先在刚果民主共和国的概率为94%，而起源在RG的概率仅为0.03%。

分析还证实敖德萨是A的震中_前苏联疫情与已知的流行病学数据一致，具有向乌克兰、俄罗斯、白俄罗斯、哈萨克斯坦和乌兹别克斯坦其他城市传播的良好支持途径。关于A的时间起源_前苏联，据估计，从刚果民主共和国到敖德萨的最早迁移时间是在1970年左右，A_前苏联在敖德萨开始通过异性接触传播，大约在1994年在注射吸毒者中爆发前十年。没有特定的历史事件可以与A族的迁移联系起来_前苏联从刚果民主共和国到乌克兰的祖先，这可能是一种偶然现象，类似于其他非洲HIV-1变异向不同非洲以外国家的迁移。随后发生的事件，例如1991年苏联解体后社会经济条件的恶化以及从阿富汗出发的毒品贩运路线的建立，可能为A . A .的迅速扩散创造了最佳条件_前苏联从乌克兰南部到其他前苏联国家。因此，这些结果提供了关于HIV-1变异的起源和传播途径的新信息，这种变异在东欧和中亚国家的HIV-1流行病中占主导地位，从历史和公共卫生的角度来看，这可能是有趣的。从这些研究中获得的知识可能有助于实施旨在遏制当前艾滋病毒-1流行病和预防未来流行病的公共卫生措施。

迈克尔·汤姆森和旧金山Diez-Fuertes
国家中心Microbiología
卡洛斯三世研究所
Majadahonda，马德里，西班牙

出版

贝叶斯系统地理学分析阐明了在前苏联国家流行的HIV-1亚型A变体的起源。
Díez-Fuertes F, Cabello M, Thomson MM。
感染与基因进化。2015年7月

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