利用先进的固态核磁共振方法潜入细胞膜:利用质子的力量

膜蛋白是细胞的通道。它们对细胞间的信号传递和营养物质的吸收至关重要;它们是人类主要的药物靶点,它们的功能失调与囊性纤维化或帕金森等严重疾病有关。要了解膜蛋白及其功能失调,结构知识是基础。固态核磁共振(ssNMR)光谱是一种高分辨率研究膜蛋白的强大技术。ssmr光谱的一个特别优势是可以直接在异质蛋白脂质体中进行研究。

图1所示。

原则上,ssNMR光谱甚至允许研究细胞膜中的膜蛋白,即直接在天然生理条件下。这种真正的本土研究被认为是结构生物学的圣杯。这是因为膜蛋白受其所处的膜环境的强烈调节,只有本地研究才能保证对膜蛋白的相关状态(如可用药状态)进行研究。官方manbetx手机版然而,由于靶蛋白的浓度非常稀释,传统的ssNMR光谱在天然细胞膜制剂中具有较低的光谱灵敏度。

在我们最近发表的文章中,我们介绍了一种超灵敏的ssNMR方法,使我们能够研究天然细胞膜中最微小的纳摩尔浓度的典型钾通道KcsA。这一成就是利用质子的能量实现的。ssmr光谱中的质子探测具有巨大的灵敏度优势,光谱强度可以提高一个数量级以上,从而大大加快了测量速度。以前,质子检测需要高度氘化的膜蛋白,这使得研究细胞制备中的跨膜部分成为不可能。

为了定量研究膜蛋白在其原生细胞环境中的作用,我们引入了一种新的方法,称为分数氘化,它结合了侧链的适度氘化(~ 30%)和超高速样品旋转。这种方法在不牺牲任何重要信息的情况下,对膜蛋白提供了很高的分辨率和灵敏度。

首先,在蛋白脂质体中,我们使用这种方法研究了KcsA选择性过滤器的动力学,这是一个在所有钾通道中保守的关键功能元件,这些通道参与人体的基本功能,如神经元信号传导和肌肉收缩。其次,我们的质子检测ssNMR方法的高灵敏度甚至使我们能够直接在天然细胞膜和原子水平上研究KcsA通道。重要的是,我们的数据强烈表明,选择性过滤器在天然细胞膜中也显示出增加的分子动力学。

图2所示。Weingarth小组开发了不同的质子检测标记方案,用于研究膜蛋白的不同部分。部分氘化(FD,绿色)可获得暴露于水的部分;逆分数氘化(iFD,蓝色和洋红色)可以获得全膜蛋白或仅跨膜部分。这些标记方案也直接作用于原生细胞膜(如图所示)。

总之,我们的研究首次证明了使用定量质子检测细胞膜蛋白的ssNMR光谱。我们期望我们的方法将为天然细胞条件下和原子水平上膜蛋白的结构研究开辟新的途径。

jo o Medeiros-Silva, Markus Weingarth
Bijvoet生物分子研究中心核磁共振光谱学组,官方manbetx手机版
荷兰乌得勒支大学理学院化学系

出版

1体外和原位氢检测水不可接近蛋白的固态核磁共振研究。
Medeiros-Silva J, Mance D, Daniëls M, Jekhmane S, Houben K, Baldus M, Weingarth M
新化学国际教育英语2016年10月17日

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