利用效应剂对扁豆炭疽病病原菌小种的分化

刺盘孢属在过去的十年里一直在修订。它包含作为主要作物病原体的高经济重要性物种,但也包括作为研究宿主-病原体相互作用的模式生物的物种。的hemibiotroph晶状体刺盘孢属,炭疽病的病原体镜头culinaris(扁豆)最近被描述为一个新种。在宿主细胞中,c .慢病毒最初产生粗大的生物营养初级菌丝,局限于一个表皮细胞,然后通过发育细细的丝状次级菌丝侵入其他宿主细胞而进入坏死性阶段。

在与寄主植物相互作用的过程中,c .慢病毒可能分泌大量的效应蛋白,包括毒素,以操纵植物的先天免疫,从而获得进入宿主组织的营养。在网上表达序列标签的分析c .慢病毒-感染的扁豆小叶组织鉴定出15个候选效应物。在种内水平没有观察到正选择压力的迹象,这表明c .慢病毒效应器处于稳定选择状态。在足底通过RT-qPCR分析了侵染期、生物营养期和坏死期候选效应物的侵染期特异性基因表达波。15个同系物中有10个c .慢病毒候选效应物在其他几种植物中被鉴定刺盘孢属具有超过65%的多肽序列跨物种一致性。同样,一种毒素蛋白ClToxB由具有四个特征半胱氨酸残基的单拷贝基因编码,并通过异源基因进一步表征为一种潜在的宿主特异性毒素在足底在包括3个物种在内的5个物种中具有广泛相似的同源物刺盘孢属这表明不同但相关的物种的效应并不像以前认为的那样独特。在网上分析ClToxB序列和比较基因组学表明ToxB不太可能是外星人的基因c .慢病毒基因组。建立的物种关系与建立在…基础上的物种关系之间的一致性ToxB序列数据证实它是从一个共同的祖先进化而来的,而细菌基因参数经环境检测技术鉴定的c .慢病毒编码精氨酸琥珀酸裂解酶是水平从细菌中转移过来的就像之前展示的那样刺盘孢属物种。击倒…ClToxBRNAi转录本导致毒力降低,表明ClToxB是一个毒力因子。

在加拿大的人群中发现了两个致病小种(强毒小种0和弱毒小种1)c .慢病毒。候选效应物的开放阅读框中存在沉默的单核苷酸多态性ClCE6利用竞争性等位基因特异性PCR标记,在0种分离株和1种分离株之间分化良好,表明该标记可能与毒力控制位点/位点共分离,因此可用于确定c .慢病毒隔离。竞赛索引c .慢病毒分离株不仅对监测病原菌种群动态,而且对田间条件下的种质筛选具有重要意义。

出版

候选效应物有助于扁豆炭疽病病原体的小种分化和毒力。
Bhadauria V, MacLachlan R, Pozniak C, Banniza S
BMC Genomics, 2015年8月22日

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