假单胞菌是一种丰富的细菌群，可以生活在土壤中。在这个栖息地中，许多生物，如真菌、细菌、植物或昆虫，生活在一起，经常在紧密的社区中密切互动。这些群落的组成在不同的植物种类和环境条件下具有很大的特点。对几种荧光假单胞菌有有益的促生作用。即使是对植物病原体的直接拮抗生物防治作用，也可以通过这种方式研究额外的间接植物促进作用。1994年荧光假单胞菌本研究分析的菌株DSM 8569是从德国罗斯托克油菜根周土壤中分离出来的。油菜是黄萎病真菌的寄主植物之一，黄萎病真菌生活在土壤中，通过根系感染寄主。2006年对黄萎病有很强的生物防治潜力p .荧光DSM 8569。据推测，拮抗根瘤菌的生物防治潜力是由于其分泌各种具有毒性的代谢物。对于荧光假单胞菌，已知有多种具有抗真菌作用的分泌次生代谢物，如2,4-二乙酰间苯三酚(DAPG)， pyoluteorin，氰化氢(HCN)或pyrrolnitrin。在菌株中发现了一种叫做gacA-gacS的双组分系统假单胞菌protegens它调节这些化合物的合成和分泌。具有真菌毒性的非那嗪是由p .荧光2-79并被描述为其生物防治战略的关键要素。目前，尚不清楚哪种抑制机制负责拮抗潜力p .荧光DSM 8569。基因组测序将有助于了解荧光假单胞菌的促植物和拮抗潜能。

生物防治菌株的基因组DNAp .荧光DSM 8569是由美国Illumina公司的下一代测序技术分离和测序的。在基因组序列草图中，我们发现了2个核糖体RNA簇，43个转移RNA基因，4,560个编码预测蛋白质功能的基因，以及1,354个编码假设蛋白质的基因。在进一步分析DSM 8569中参与次级代谢的基因时，我们发现了两个负责HCN合成的基因。卟啉合成所必需的基因和描述的整个非那嗪操纵子p .荧光2-79不在p .荧光DSM 8569。至少有一个调控DAPG合成所需的基因(phlG)在DSM 8569中缺失。

与生物防治菌株的序列荧光假单胞菌DSM 8569我们希望支持生物防治机制的进一步研究。官方manbetx手机版通过这种方法，有望提高有益的根瘤菌假单胞菌在农业作物病害防治中的应用。

全基因组序列已存入DDBJ/EMBL/GenBank (万维网.ncbi.nlm.nih.gov /基因库）登记号JXOE00000000。本文描述的版本为第一版，JXOE01000000。

Kai Nesemann, Gerhard H. Braus
德国微生物与遗传研究所Georg-August-Universität
德国哥廷根

出版

油菜(Brassica napus)天然分离物荧光假单胞菌根瘤菌DSM 8569基因组序列草图
Nesemann K, Braus- stromeyer SA, Thuermer A, Daniel R, brus GH
2015年3月26日

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