多发性硬化症脑损伤或修复的RNA特征及ms图谱

我们探索了进展性MS患者大脑中不同病变类型的机制特征:与对照脑白质区相比,外观正常的白质(NAWM)、活动性、慢性活动性(缓慢扩张)、非活动性和修复性(髓鞘再生)病变。通过对来自这些不同MS病变类型的约100个脑区域的综合组织转录组学和生物信息学,我们还建立了一个独特的公共、互动的激活基因分子数据库:MS图谱(图1)。

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图1所示。建立进展性多发性硬化症脑损伤类型的分子特征。在对MS脑的不同病变类型进行分类和显微解剖后,我们通过RNA测序进行了全面的转录组分析,并创建了MS- atlas。通过无偏倚的从头富集蛋白-蛋白网络分析,我们发现TGFBR2是不同病变类型共享的显著表达基因的主要枢纽。由Biorender.com创建。

我们对多个病变亚群的无偏搜索提供了通过不同方法验证的特定分子特征的发现。其中,我们发现细胞因子受体TGFbR2是新创在所有不同MS病变类型中,共有差异表达基因的分子网络(FDR<0.05)(图1)。我们还发现,慢性活动、缓慢扩张的病变具有最独特的特征和最多的独特显著表达基因(n=2213),其中约70%与轴突/神经元功能相关(图2)。

此外,我们利用转录组数据创建了一个在线数据库,MS- atlas,用于国际MS研究。官方manbetx手机版这个交互式的用户友好的在线网络服务(www.msatlas.dk)也有助于其他神经系统疾病的研究,因为它允许研究人员和临床医生(官方manbetx手机版)寻找某些感兴趣的分子,(2)比较功能性细胞/动物研究的基因面板,以及(3)发现机械标记使用新创不同病变类型的网络富集(图1)。

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图2所示。多发性硬化症脑部慢性活动、缓慢扩张病变的独特性。通过比较不同病变类型中所有显著调控的基因,慢性活动性病变的独特基因数量最多。慢性活动性病变也高度富集神经元/轴突特异性生物过程,这些过程由预定义的细胞成分指示。由Biorender.com创建。

总之,我们建立了进展性MS大脑中不同病变类型的分子特征,这可能有助于理解慢性持续组织损伤背后的分子过程修复。我们的质谱图谱是推动未来质谱研究的宝贵资源,也是治疗开发的新基础。官方manbetx手机版

Maria L. Elkjaer, Zsolt Illes
南丹麦大学欧登塞大学医院神经内科,丹麦欧登塞

出版

进行性多发性硬化症患者脑白质不同病变类型的分子特征
Elkjaer ML, Frisch T, Reynolds R, Kacprowski T, Burton M, Kruse TA, Thomassen M, Baumbach J, Illes Z。
《神经病理学杂志》2019年12月11日

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